На свет появляются один-два детеныша.
В некоторых районах Южной Америки люди держат маргая вместо домашней кошки. В последние годы из-за вырубки тропических лесов поголовье маргая заметно сократилось. К тому же браконьеры нередко убивают его ради красивого - густого и мягкого - меха. Сейчас длиннохвостой кошке, как и многим другим кошачьим с красивой шерстью грозит вымирание.
Исключительно подвергнутый опасности уничтожения вид в пределах всего ареала. В прошлом, тысячи индивидуумов за год уничтожались из-за своего меха. Охотничий пресс на популяцию маргая значительно уменьшила организованная международная защита вида, хотя некоторый нелегальный отстрел животных все еще происходит в местном масштабе. Фактически эксклюзивное использование лесных местообитаний, их разрушение и фрагментация, возможно, делает этот вид более уязвимым к отрицательным эффектам, чем оцелота.