Как большинство крупных кошек, ягуар ведёт одиночную жизнь. Площадь пространства, используемого каждым хищником, определяется количеством доступной добычи. Она может варьировать от 5 до 500 кв. км.
Джордж Шаллер, изучавший популяцию ягуаров в Бразилии, выяснил, что размеры участков самок варьируют от 25 до 35 кв. км и значительно перекрываются между собой. Территории самцов примерно в 2 раза больше, не перекрываются между собой, но включают в себя участки (или часть их) нескольких самок.
Другой исследователь, А.Рабинович, выяснил, что на 370 кв. км обитали 25-30 ягуаров. На этом пространстве между всеми животными, вероятно, бывают контакты. Ягуар не использует всё жизненное пространство равномерно. В зависимости от количества потенциальной добычи, он может задерживаться в одном из участков несколько дней, пока не истощатся источники. Тогда хищник перемещается на другой участок.
Чтобы заявить о своём присутствии, ягуар чаще всего использует пахучие метки, разбрызгивая мочу на камни или деревья. Задирая кору на стволах деревьев, он оставляет визуальные метки, обозначающие границы его территории.
Иногда, по невыясненным причинам самцы совершают дальние путешествия. Известен рекордный случай, когда ягуар удалился от своего постоянного участка на 800 км.